RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 NACC1Q96RE7 527 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAM2Q99965 735 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS18Q9NS28 235 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A087WZ62 844 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 DENND3A2RUS2 1198 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01553A4QN01 128 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 MGEA5O60502 916 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PRPHP41219 470 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RARRES1P49788 294 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RFXAPO00287 272 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SYT1P21579 422 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 EMC2Q15006 297 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 BRAPQ7Z569 592 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SPRED2Q7Z698 418 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF410Q86VK4 478 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TCP11Q8WWU5 503 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 MTRQ99707 1265 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB34Q9BZG1 259 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 STK24Q9Y6E0 443 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ASAP2O43150 1006 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 DGAT1O75907 488 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 STAG3L1P0CL83 205 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 FGFR4P22455 802 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRE1Q14246 886 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 DSC3Q14574 896 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 FERMT3Q86UX7 667 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 NLRP4Q96MN2 994 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 EVPLQ92817 2033 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP4-204ENST00000416021 EPOPA6NHQ4 379 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 DGKIO75912 1065 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MUTP22033 750 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 IGFBP4P22692 258 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVK-21P61565 698 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM189BP81408 668 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ECM1Q16610 540 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 POTEGQ6S5H5 508 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HSCBQ8IWL3 235 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 C9IYK1 514 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR81Q562E7 1941 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC25AP30304 524 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT79Q5XKE5 535 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 FIBCD1Q8N539 461 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 CDH23Q9H251 3354 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 SIP14410 1827 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 PP2D1A8MPX8 630 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.351e-6■■■■□ 19.5
SH3BP4-204ENST00000416021 ARL2P36404 184 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF149Q8NC42 400 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 CHST12Q9NRB3 414 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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