RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 CCDC169A6NNP5 214 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 KRT31Q15323 416 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 THAP9Q9H5L6 903 aa22.21■■□□□ 1.15
ODC1-202ENST00000405333 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 BEX3Q00994 111 aa22.2■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 IRF5Q13568 498 aa22.2■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.2■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 SRRDQ9UH36 339 aa22.2■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.2■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 A6NJR5 290 aa22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 H3BRB1 525 aa22.19■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 DGKDQ16760 1214 aa22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.19■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 TISP43B9A030 160 aa22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 INSRRP14616 1297 aa22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 NCKAP1LP55160 1127 aa22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 CHMP4BP1P59074 171 aa22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 TSG101Q99816 390 aa22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.19■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 MYADML2A6NDP7 307 aa22.18■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 TEX33O43247 280 aa22.18■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 CNGA1P29973 690 aa22.18■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 RFC5P40937 340 aa22.18■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.18■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 PDXKO00764 312 aa22.16■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 GTF2BQ00403 316 aa22.16■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 KAT2BQ92831 832 aa22.16■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 DENND3A2RUS2 1198 aa22.16■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.16■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 ADCY3O60266 1144 aa22.16■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 NR2F2P24468 414 aa22.16■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 NR1I3Q14994 352 aa22.16■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.16■■□□□ 1.14
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ODC1-202ENST00000405333 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.16■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.16■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 USP20Q9Y2K6 914 aa22.16■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 C22orf31O95567 290 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 PGK1P00558 417 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 CLCN3P51790 818 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 SMTNP53814 917 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 METTL13Q8N6R0 699 aa22.15■■□□□ 1.14
ODC1-202ENST00000405333 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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