RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 NCKAP1LP55160 1127 aa16.88■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 GTF2BQ00403 316 aa16.88■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGAP1Q07960 439 aa16.88■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MORN1Q5T089 497 aa16.88■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 FAM160B1Q5W0V3 765 aa16.88■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM59Q8IWR1 403 aa16.88■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TINF2Q9BSI4 451 aa16.88■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 GBP3Q9H0R5 595 aa16.88■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.88■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 NRBP2Q9NSY0 501 aa16.88■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 LGR5O75473 907 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 GNA14O95837 355 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CYP2J2P51589 502 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MARSP56192 900 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 KCNMA1Q12791 1236 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CRHR2Q13324 411 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 EMC2Q15006 297 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SMC1BQ8NDV3 1235 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC102AQ96A19 550 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 AZI2Q9H6S1 392 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 VTA1Q9NP79 307 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.87■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MFAP3LO75121 409 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 INHBEP58166 350 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CYP4F22Q6NT55 531 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 KIFAP3Q92845 792 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ACCSQ96QU6 501 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 KMT5AQ9NQR1 393 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 UBE4BO95155 1302 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CTGFP29279 349 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 KCNH2Q12809 1159 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PLCB4Q15147 1175 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 FRMD5Q7Z6J6 570 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 RDH13Q8NBN7 331 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MCPH1Q8NEM0 835 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SPTLC3Q9NUV7 552 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 DMAC2Q9NW81 257 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 EVPLQ92817 2033 aa16.86■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CENPFP49454 3210 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB42B2RXF5 422 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 EPHB6O15197 1021 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SMPD1P17405 629 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SMTNP53814 917 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 DRP2Q13474 957 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ACVR2BQ13705 512 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MTF1Q14872 753 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ASAP3Q8TDY4 903 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB10Q96DT7 871 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 BORCS6Q96GS4 357 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PANX2Q96RD6 677 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TBX20Q9UMR3 447 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 USP20Q9Y2K6 914 aa16.85■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 DENND3A2RUS2 1198 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ADCY6O43306 1168 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 KRT9P35527 623 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TM4SF4P48230 202 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 APBA1Q02410 837 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MAP2K5Q13163 448 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 LAMC2Q13753 1193 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CCL14Q16627 93 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 NFIL3Q16649 462 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 AFG1LQ8WV93 481 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.84■□□□□ 0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms