RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 HIPK4Q8NE63 616 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 TOR3AQ9H497 397 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 ASB1Q9Y576 335 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 SCDO00767 359 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 VPS37DQ86XT2 251 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 TCF25Q9BQ70 676 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 IL23AQ9NPF7 189 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 KIAA0355O15063 1070 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 FOXP2O15409 715 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 B3GALT2O43825 422 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 CD38P28907 300 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 GUCY1A3Q02108 690 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 TCIRG1Q13488 830 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 MB21D1Q8N884 522 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 PTPRN2Q92932 1015 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 DNM2P50570 870 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 MAP3K12Q12852 859 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 CALML6Q8TD86 181 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 ITGB6P18564 788 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 SDHAP31040 664 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 ANTXR2P58335 489 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 NBPF4Q96M43 638 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 COX11Q9Y6N1 276 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 GSTA4O15217 222 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 GAGE13Q4V321 117 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 DLG3Q92796 817 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 Q6YL49 198 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 KLF4O43474 513 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 RASGRP1O95267 797 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 PTTG1IPP53801 180 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 MFSD5Q6N075 450 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 ADCY3O60266 1144 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 MFAP3LO75121 409 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 PPFIA4O75335 1185 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 TOX4O94842 621 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 CDK4P11802 303 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 CLEC14AQ86T13 490 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 FOXB1Q99853 325 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 CRTAMO95727 393 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-202ENST00000367364 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.55□□□□□ -1.36
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