RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359785.9

PTPN22-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN22, Length 3,654 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22-201ENST00000359785 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 SLC9A9Q8IVB4 645 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 NSMCE1Q8WV22 266 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 KIFAP3Q92845 792 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 CGREF1Q99674 301 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 TRIM9Q9C026 710 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 ZMYND12Q9H0C1 365 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 DCLRE1BQ9H816 532 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPN22-201ENST00000359785 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 FOXO6A8MYZ6 492 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF213O14771 459 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PSMA7O14818 248 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 XBP1P17861 261 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 CHRNA3P32297 505 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 MSH2P43246 934 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PSMD8P48556 350 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 CD97P48960 835 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 IKZF1Q13422 519 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ADAM9Q13443 819 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 APOFQ13790 326 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 GRM4Q14833 912 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ESCO1Q5FWF5 840 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 SH2D4BQ5SQS7 431 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ARMC3Q5W041 872 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF449Q6P9G9 518 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 NT5DC3Q86UY8 548 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 SPATA5Q8NB90 893 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 DDX12PQ92771 950 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 DOK1Q99704 481 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 BOLA2Q9H3K6 86 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 DENRO43583 198 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PHF2O75151 1096 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 LRRN2O75325 713 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 GAS8O95995 478 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 MAPTP10636 758 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PDHBP11177 359 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PAFAH1B1P43034 410 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 NUMBP49757 651 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PEX5P50542 639 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 CCDC14Q49A88 953 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 TMEM259Q4ZIN3 620 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 FOXB2Q5VYV0 432 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 VSTM1Q6UX27 236 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 TICAM1Q8IUC6 712 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PLCD3Q8N3E9 789 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ALLCQ8N6M5 410 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 FANCBQ8NB91 859 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 SIX2Q9NPC8 291 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 SALL4Q9UJQ4 1053 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 BLOC1S6Q9UL45 172 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 A0A088AWK7 358 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 MAGEA13PA6NCF6 341 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 SLC22A2O15244 555 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 RAD51CO43502 376 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 AKR1B10O60218 316 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 TTLL1O95922 423 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 FAM153BP0C7A2 387 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 RHOXF2BP0C7M4 288 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 GRIN1Q05586 938 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 C2orf54Q08AI8 447 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 PTK6Q13882 451 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 TRIM29Q14134 588 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 FAM153CQ494X1 144 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 TTC38Q5R3I4 469 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ACAD11Q709F0 780 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 TRIM22Q8IYM9 498 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 CCDC63Q8NA47 563 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 TPCN2Q8NHX9 752 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPN22-201ENST00000359785 RHOXF2Q9BQY4 288 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms