RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BARHL2Q9NY43 387 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MACROD2A1Z1Q3 448 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ASAP2O43150 1006 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GAS2O43903 313 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 UQCRHP07919 91 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 HOXC6P09630 235 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ATXN8OSP0DMR3 200 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ARP10275 920 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MYO1EQ12965 1108 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PLCB4Q15147 1175 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SHHQ15465 462 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP15Q5T1M5 1219 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NOTUMQ6P988 496 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 AFAP1L1Q8TED9 768 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 KIF12Q96FN5 646 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ACAP3Q96P50 834 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SPAG5Q96R06 1193 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4F11Q9HBI6 524 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NRBP1Q9UHY1 535 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TREHO43280 583 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NPTXRO95502 500 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 OATP04181 439 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PRKCBP05771 671 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PPM1AP35813 382 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SLC26A2P50443 739 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MYL7Q01449 175 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 HSDL1Q3SXM5 330 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GLRA4Q5JXX5 417 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PPM1LQ5SGD2 360 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 VSIG10LQ86VR7 867 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ATP8B4Q8TF62 1192 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MKL1Q969V6 931 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PCIF1Q9H4Z3 704 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC18Q9H819 358 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GDPD2Q9HCC8 539 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 IL23AQ9NPF7 189 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 KANSL3Q9P2N6 904 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ARAP2Q8WZ64 1704 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SOWAHBA6NEL2 793 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 POTEMA6NI47 508 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PSMA7O14818 248 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SLC16A4O15374 487 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 XYLBO75191 536 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINC1P01008 464 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 YWHABP31946 246 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 USP11P51784 963 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 EPHA7Q15375 998 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R18Q6NYC8 613 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SGMS1Q86VZ5 419 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RGS22Q8NE09 1264 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FAM149B1Q96BN6 582 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TNMDQ9H2S6 317 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 JADE2Q9NQC1 790 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SPG21Q9NZD8 308 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DUOX1Q9NRD9 1551 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TNNT1P13805 278 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 XPAP23025 273 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RDXP35241 583 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PPP2R3AQ06190 1150 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CAMK4Q16566 473 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FAM171A1Q5VUB5 890 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FAM173BQ6P4H8 233 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BRAPQ7Z569 592 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NOSTRINQ8IVI9 506 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ARMC5Q96C12 935 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NOX5Q96PH1 765 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 IL17RBQ9NRM6 502 aa4.86□□□□□ -1.63
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