RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 F8VZ95 297 aa22.65■■□□□ 1.22
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KCNQ1-202ENST00000335475 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.65■■□□□ 1.22
KCNQ1-202ENST00000335475 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM49CP0CI26 452 aa22.64■■□□□ 1.21
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KCNQ1-202ENST00000335475 FERP16591 822 aa22.64■■□□□ 1.21
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KCNQ1-202ENST00000335475 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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KCNQ1-202ENST00000335475 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.6■■□□□ 1.21
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KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM59LQ9UK28 342 aa22.6■■□□□ 1.21
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KCNQ1-202ENST00000335475 MTMR2Q13614 643 aa22.59■■□□□ 1.21
KCNQ1-202ENST00000335475 PLS1Q14651 629 aa22.59■■□□□ 1.21
KCNQ1-202ENST00000335475 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
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KCNQ1-202ENST00000335475 GDF3Q9NR23 364 aa22.59■■□□□ 1.21
KCNQ1-202ENST00000335475 NCANO14594 1321 aa22.59■■□□□ 1.21
KCNQ1-202ENST00000335475 PHACTR2O75167 634 aa22.59■■□□□ 1.21
KCNQ1-202ENST00000335475 GLI1P08151 1106 aa22.59■■□□□ 1.21
KCNQ1-202ENST00000335475 RPS6KA1Q15418 735 aa22.59■■□□□ 1.21
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