RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330687.8

CMTM4-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-201ENST00000330687 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.2■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.2■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TDP2O95551 362 aa22.2■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 COASYQ13057 564 aa22.2■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.2■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 C5P01031 1676 aa22.2■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ETS2P15036 469 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 KCNA3P22001 575 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 CALCOCO2Q13137 446 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TBC1D25Q3MII6 688 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 RNF8O76064 485 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 USP17L8P0C7I0 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ALADP13716 330 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TRIM74Q86UV6 250 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TRIM73Q86UV7 250 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ITFG2Q969R8 447 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 PWWP2AQ96N64 755 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TEX9Q8N6V9 391 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 STK32AQ8WU08 396 aa22.19■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 CLIC2O15247 247 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 CLSTN1O94985 981 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 GM2AP17900 193 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 FAM13CQ8NE31 585 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TMEM165Q9HC07 324 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 RPTORQ8N122 1335 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 PYGBP11216 843 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 DYDC2Q96IM9 177 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 MEGF6O75095 1541 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 MYH1P12882 1939 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 E9PMD0 336 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 PDE8AO60658 829 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 LRRN2O75325 713 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 KYNUQ16719 465 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.18■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 WDR91A4D1P6 747 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 UNC5CO95185 931 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 MARCKSL1P49006 195 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 KLRC3Q07444 240 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 PHC3Q8NDX5 983 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 AK8Q96MA6 479 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ATRNO75882 1429 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 RICTORQ6R327 1708 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 RIPK2O43353 540 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TPBGLP0DKB5 382 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 MGAT5Q09328 741 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 DUPD1Q68J44 220 aa22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 PEX11AO75192 247 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TSPY3P0CV98 308 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TSPY8P0CW00 308 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ATP6V1C1P21283 382 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 MAPK7Q13164 816 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 MESDQ14696 234 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 DCTN4Q9UJW0 460 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 DISP2A7MBM2 1401 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 NID2Q14112 1375 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 KLRF2D3W0D1 207 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 CYTH3O43739 400 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 PTENP60484 403 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 MPP2Q14168 576 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 ALG3Q92685 438 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 PNMA5Q96PV4 448 aa22.16■■□□□ 1.14
CMTM4-201ENST00000330687 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms