RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CAMK4Q16566 473 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 SERINC5Q86VE9 423 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 TOX2Q96NM4 488 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 REEP2Q9BRK0 252 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 ASAP2O43150 1006 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CUL4BQ13620 913 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 SNX17Q15036 470 aa23.42■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 PPP2R5AQ15172 486 aa23.42■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.42■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.42■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.42■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 PARVGQ9HBI0 331 aa23.42■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.42■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 PANK4Q9NVE7 773 aa23.42■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 BRCA2P51587 3418 aa23.42■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 M0QZ92 97 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 TRAK2O60296 914 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 GAP43P17677 238 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 ARL2P36404 184 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 RTP1P59025 263 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 TLE2Q04725 743 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 TRIM60Q495X7 471 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 MYCT1Q8N699 235 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 POLD4Q9HCU8 107 aa23.41■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CASP1P29466 404 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 SMTNP53814 917 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 DPYDQ12882 1025 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 PNOCQ13519 176 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 TFDP1Q14186 410 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 ODR4Q5SWX8 454 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 UNC13DQ70J99 1090 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 SMARCE1Q969G3 411 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 SCLT1Q96NL6 688 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 RMND1Q9NWS8 449 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.4■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 SFI1A8K8P3 1242 aa23.39■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 RPN1P04843 607 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 PLS3P13797 630 aa23.39■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 THPOP40225 353 aa23.39■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 DRP2Q13474 957 aa23.39■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.39■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 RPAINQ86UA6 219 aa23.39■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 EXOC1Q9NV70 894 aa23.39■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 CD4P01730 458 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 VTNP04004 478 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 PRR29P0C7W0 189 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 RSPH10BP0C881 870 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 BFSP2Q13515 415 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 DAW1Q8N136 415 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 CAGE1Q8TC20 777 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 GSDMAQ96QA5 445 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 CCDC169A6NNP5 214 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 CAND2O75155 1236 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 ZNF131P52739 623 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 PEX3P56589 373 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 MAPK7Q13164 816 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 NLRP7Q8WX94 980 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 NLRP4Q96MN2 994 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.38■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.37■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 H0YCG3 227 aa23.37■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 GLRA2P23416 452 aa23.37■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 NAMPTP43490 491 aa23.37■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.37■■□□□ 1.33
YBX1-201ENST00000321358 DEPTORQ8TB45 409 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms