RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 PDCLQ13371 301 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PDXDC1Q6P996 788 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM35BQ8NCS4 154 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SLC10A4Q96EP9 437 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CRAMP1Q96RY5 1269 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ZBTB7AO95365 584 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 BAG2O95816 211 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PSMA2P25787 234 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ECE1P42892 770 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CATSPER4Q7RTX7 472 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PDIK1LQ8N165 341 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 NUF2Q9BZD4 464 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CCDC68Q9H2F9 335 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 VCXQ9H320 206 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 NDUFB10O96000 172 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 GSTA1P08263 222 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 GSTA2P09210 222 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 GRIN1Q05586 938 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 MUM1Q2TAK8 710 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CCHCR1Q8TD31 782 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 TCP11Q8WWU5 503 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 KIAA1586Q9HCI6 787 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 MRFAP1Q9Y605 127 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SFNP31947 248 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PSMC5P62195 406 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SH2D3AQ9BRG2 576 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa10.64□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CA4P22748 312 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CD163L1Q9NR16 1453 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 EYA4O95677 639 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 EPHA7Q15375 998 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 HAUS6Q7Z4H7 955 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM60Q9H2L4 133 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PODXLO00592 558 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF18P17022 549 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ABI1Q8IZP0 508 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 OR6B3Q8NGW1 331 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 GDAP1Q8TB36 358 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 FTLP02792 175 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 KRT39Q6A163 491 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ZBED1O96006 694 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 RCN2Q14257 317 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ENGASEQ8NFI3 743 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 FAM167AQ96KS9 214 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 RHOBTB3O94955 611 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SPDYE2Q495Y8 402 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 TRIM68Q6AZZ1 485 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 BCAP29Q9UHQ4 241 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 EMSYQ7Z589 1322 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 GGCXP38435 758 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PRPSAP1Q14558 356 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 RAPH1Q70E73 1250 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 KLHL29Q96CT2 875 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 EDEM3Q9BZQ6 932 aa10.63□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 REREQ9P2R6 1566 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PYROXD1Q8WU10 500 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 GINM1Q9NU53 330 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 WDR91A4D1P6 747 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 STXBP3O00186 592 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PDXKO00764 312 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 GPC4O75487 556 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF568Q3ZCX4 644 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 MCUQ8NE86 351 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 MYMKA6NI61 221 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ASPHQ12797 758 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 TROAPQ12815 778 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 METTL23Q86XA0 190 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SCYL3Q8IZE3 742 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 DCLK2Q8N568 766 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 HSPH1Q92598 858 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF302Q9NR11 478 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ANKRD65E5RJM6 399 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PDHBP11177 359 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 CENPUQ71F23 418 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 PIK3C2BO00750 1634 aa10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 SART1O43290 800 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TMOD3-201ENST00000308580 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms