RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 TATDN2Q93075 761 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CEP63Q96MT8 703 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SH2D3AQ9BRG2 576 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 EDEM3Q9BZQ6 932 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 FAM196BA6NMK8 535 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 FOXO6A8MYZ6 492 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PLCB4Q15147 1175 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ZBTB10Q96DT7 871 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ADCY2Q08462 1091 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 BARGINQ6ZT62 677 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ERP44Q9BS26 406 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PLVAPQ9BX97 442 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ATRNO75882 1429 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 USP17L10C9JJH3 530 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 TOM1O60784 492 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 LMNB1P20700 586 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 MCM8Q9UJA3 840 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 NR2E1Q9Y466 385 aa16.51■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PASKQ96RG2 1323 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 RSPH10B2B2RC85 870 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 GNPATO15228 680 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 RSPH10BP0C881 870 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 RFX8Q6ZV50 586 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 HOOK2Q96ED9 719 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 HEMGNQ9BXL5 484 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 FAM129AQ9BZQ8 928 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 TMEM120BA0PK00 339 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SPAG7O75391 227 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 DLATP10515 647 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 RASA1P20936 1047 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ALDH3A1P30838 453 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SCNN1DP51172 638 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 GSCP56915 257 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 FAM178BQ8IXR5 827 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ARMC2Q8NEN0 867 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 AGAP11Q8TF27 550 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PITPNM3Q9BZ71 974 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CTNNA2P26232 953 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SGO2Q562F6 1265 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 C10orf76Q5T2E6 689 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.233e-6■■□□□ 13.4
USP25-201ENST00000285679 VPS37BQ9H9H4 285 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 C5P01031 1676 aa16.5■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 FLT1P17948 1338 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CFBP00751 764 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 IFNB1P01574 187 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 DDR1Q08345 913 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SCFD1Q8WVM8 642 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 THAP2Q9H0W7 228 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 RASSF9O75901 435 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ATP5DP30049 168 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 NMT1P30419 496 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 POLE2P56282 527 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 IKZF4Q9H2S9 585 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PARP2Q9UGN5 583 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 NHSL1Q5SYE7 1610 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 A8MUI8 341 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 FTLP02792 175 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CRYMQ14894 314 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ODR4Q5SWX8 454 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 KAZNQ674X7 775 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 BTBD6Q96KE9 485 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 RGL1Q9NZL6 768 aa16.49■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ECEL1O95672 775 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PON1P27169 355 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 GTF2IP78347 998 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 HHATQ5VTY9 493 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 TRIM59Q8IWR1 403 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SORBS3O60504 671 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 NOL4O94818 638 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 BCRP11274 1271 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 CASP5P51878 434 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 RAD23BP54727 409 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 MYL7Q01449 175 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 RFFLQ8WZ73 363 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF653Q96CK0 615 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 DRD4P21917 467 aa16.48■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms