RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L24Q0WX57 530 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 HSPH1Q92598 858 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CHEK2O96017 543 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF18P17022 549 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 DEUP1Q05D60 604 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 RNF139Q8WU17 664 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP4Q96MN2 994 aa22.61■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ORC4O43929 436 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TTC17Q96AE7 1141 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 POTEB3A0JP26 581 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 POTECB2RU33 542 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 KCNQ4P56696 695 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 SNAP25P60880 206 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 POTEBQ6S5H4 581 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 DONSONQ9NYP3 566 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 PFASO15067 1338 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MED14O60244 1454 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JND7 137 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CEP95Q96GE4 821 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 PFDN1O60925 122 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TADA3O75528 432 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA4LO95757 839 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 RUBCNQ92622 972 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 FIS1Q9Y3D6 152 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.6■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CD209Q9NNX6 404 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 GSTA4O15217 222 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CFLARO15519 480 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CDO1Q16878 200 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC43Q8N309 656 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MASTLQ96GX5 879 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 RMDN3Q96TC7 470 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TET3O43151 1660 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 GYG2O15488 501 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CRKP46108 304 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 NARFQ9UHQ1 456 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 FEM1BQ9UK73 627 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 NMT2O60551 498 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TRPA1O75762 1119 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 APOEP02649 317 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 VAMP7P51809 220 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK6Q16659 721 aa22.59■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 SFNP31947 248 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 BANK1Q8NDB2 785 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CPVLQ9H3G5 476 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TAC1P20366 129 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 LAMC1P11047 1609 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L10C9JJH3 530 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 TNFAIP2Q03169 654 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 COG1Q8WTW3 980 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 FGD4Q96M96 766 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO40Q9UH90 709 aa22.58■■□□□ 1.21
CCSAP-201ENST00000284617 SPAG7O75391 227 aa22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 GGPS1O95749 300 aa22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 FSCBQ5H9T9 825 aa22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 DYDC2Q96IM9 177 aa22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ABCB11O95342 1321 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms