RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc38a7Q8BWH0 463 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Upb1Q8VC97 393 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Polr3fQ921X6 316 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mgea5Q9EQQ9 916 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc26a4Q9R155 780 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Idh1O88844 414 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Casp14O89094 257 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mmp3P28862 477 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Defa-rs10Q64263 91 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ift122Q6NWV3 1182 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Haus7Q8BKT8 364 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Capn2O08529 700 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dlg3P70175 849 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Defb25Q30KN8 71 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pnpla5Q32LZ8 432 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ogfod1Q3U0K8 545 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ush1gQ80T11 461 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Daam2Q80U19 1115 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccer1Q9CQL2 403 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ttyh1Q9D3A9 450 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc15a2Q9ES07 729 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PigoQ9JJI6 1093 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arih2Q9Z1K6 492 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm45194A0A140LJG2 572 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cd68P31996 326 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp28Q5I043 1051 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prl2c1Q5SVL9 228 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cd300aQ6SJQ0 318 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam20aQ8CID3 541 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tlr6Q9EPW9 795 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Morc1Q9WVL5 950 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ralgapa2A3KGS3 1872 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rgs2O08849 211 aa21.83■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cer1O55233 272 aa21.83■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Clec11aO88200 328 aa21.83■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tal1P22091 329 aa21.83■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sparcl1P70663 650 aa21.83■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adamts18Q4VC17 1219 aa21.83■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa21.83■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rab30Q923S9 203 aa21.83■■□□□ 1.09
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trim30bE9PVL6 203 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vmn2r87E9PZX4 848 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kdelc2G5E897 503 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Axin1O35625 863 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Surf1P09925 306 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pcdhb14Q6PB90 796 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trim37Q6PCX9 961 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PccaQ91ZA3 724 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ier5lQ99J55 406 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vmn1r65Q9EPS7 332 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Szt2A2A9C3 3431 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm10134F6ZQC6 126 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PtenO08586 403 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Il4rP16382 810 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lamp2P17047 415 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tfdp1Q08639 410 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Oas1fQ14AZ4 364 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gse1Q3U3C9 1213 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam78aQ8C552 283 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Colgalt1Q8K297 617 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prrg2Q8R182 198 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tube1Q9D6T1 475 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sgpp1Q9JI99 430 aa21.82■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyp2b23E9Q593 491 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ChgaP26339 463 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kiaa1468Q148V7 1216 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tgfbrap1Q3UR70 860 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Capn13Q3UW68 665 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf467Q8JZL0 594 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sbk1Q8QZX0 417 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kremen1Q99N43 473 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ly6kQ9CWP4 154 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Krt85Q9Z2T6 507 aa21.81■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tpd52l1O54818 204 aa21.8■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnfaip1O70479 316 aa21.8■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pde6bP23440 856 aa21.8■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PoliQ6R3M4 717 aa21.8■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Serpina3bQ8BYY9 420 aa21.8■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mtmr3Q8K296 1196 aa21.8■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Krt79Q8VED5 531 aa21.8■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lrrc46Q9DAP0 323 aa21.8■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DgkhD3YXJ0 1156 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm3739L7N296 216 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bmpr1aP36895 532 aa21.79■■□□□ 1.08
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mcm6P97311 821 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.8 ms