RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628734.1

UBE2A-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 A, human

TSL 2

Gene UBE2A, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2A-208	ENST00000628734	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	MAFG	O15525	162 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	CDC14B	O60729	498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	EFCAB14	O75071	495 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	KCNK3	O14649	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	KCNQ2	O43526	872 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	ADH4	P08319	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	MME	P08473	750 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	SDHA	P31040	664 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	ADCY8	P40145	1251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	ECE1	P42892	770 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	KCNQ1	P51787	676 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	HGFAC	Q04756	655 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734		Q9UFV3	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	DNM2	P50570	870 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	CD83	Q01151	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	DLG3	Q92796	817 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734		E9PSI1	815 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	BMP5	P22003	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	ACRV1	P26436	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	MRE11	P49959	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	RBL2	Q08999	1139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	MOGS	Q13724	837 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	SCLY	Q96I15	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE2A-208	ENST00000628734	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2A-208	ENST00000628734	SCD	O00767	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2A-208	ENST00000628734	FOXP2	O15409	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2A-208	ENST00000628734	RASGRP1	O95267	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2A-208	ENST00000628734	FAM193A	P78312	1265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2A-208	ENST00000628734	COL10A1	Q03692	680 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2A-208	ENST00000628734	FOXL1	Q12952	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2A-208	ENST00000628734	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2A-208	ENST00000628734	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2A-208	ENST00000628734	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2A-208	ENST00000628734	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE2A-208	ENST00000628734	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBE2A-208	ENST00000628734	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms