RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ECE2	O60344	883 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	EYA4	O95677	639 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZAP70	P43403	619 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	OCRL	Q01968	901 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	NFIX	Q14938	502 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958		A0A1B0GVG6	124 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	KCNK3	O14649	394 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	KLRC1	P26715	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RFC5	P40937	340 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	IL17A	Q16552	155 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	GSTA3	Q16772	222 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	FITM2	Q8N6M3	262 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF333	Q96JL9	665 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	CEP72	Q9P209	647 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	POTEF	A5A3E0	1075 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	WNT7A	O00755	349 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	EPHB6	O15197	1021 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ITGA6	P23229	1130 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	POLE2	P56282	527 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	NPY5R	Q15761	445 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	NDN	Q99608	321 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	STOML1	Q9UBI4	398 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	NARF	Q9UHQ1	456 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	LY75	O60449	1722 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	SHBG	P04278	402 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	SKI	P12755	728 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	GYS1	P13807	737 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	PMS2	P54278	862 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	FUT2	Q10981	343 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	DBN1	Q16643	649 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RNF220	Q5VTB9	566 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	CENPP	Q6IPU0	288 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	PDHA1	P08559	390 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	CLUL1	Q15846	466 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	HAPLN3	Q96S86	360 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	USP20	Q9Y2K6	914 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	RREB1	Q92766	1687 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	KRIT1	O00522	736 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	VHL	P40337	213 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	CTSW	P56202	376 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	IWS1	Q96ST2	819 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CPEB1-215	ENST00000617958	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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