RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612154.4

SORCS1-209, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SORCS1, Length 6,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-209ENST00000612154 TNIP3Q96KP6 325 aa7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 TIPINQ9BVW5 301 aa7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 ASNSD1Q9NWL6 643 aa7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 MED14O60244 1454 aa7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 H7C4K7 107 aa7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 PI16Q6UXB8 463 aa7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 KIF12Q96FN5 646 aa7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 MXD3Q9BW11 206 aa7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 VCX3BQ9H321 246 aa7.15□□□□□ -1.26
SORCS1-209ENST00000612154 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 CYP2D6P10635 497 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 SCP2P22307 547 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 LONRF3Q496Y0 759 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 OSBP2Q969R2 916 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 MID2Q9UJV3 735 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 TLK1Q9UKI8 766 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 IPPQ9Y573 584 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 KPNA6O60684 536 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 MESDQ14696 234 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 CEP95Q96GE4 821 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa7.15□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 CHEK2O96017 543 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 INHBAP08476 426 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 PSMA2P25787 234 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 DYDC2Q96IM9 177 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 USP31Q70CQ4 1352 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 ESRRBO95718 433 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 ATP11AP98196 1134 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 MCUQ8NE86 351 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 GPC4O75487 556 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 CALB1P05937 261 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 IFNA8P32881 189 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 AMPD2Q01433 879 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 LAMC2Q13753 1193 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 PSMD6Q15008 389 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 GNASQ5JWF2 1037 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 SEPT8Q92599 483 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 FSD1LQ9BXM9 530 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 CALN1Q9BXU9 219 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 PPME1Q9Y570 386 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 ASAP2O43150 1006 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 KDM1AO60341 852 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 LRRC41Q15345 812 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 RGS12O14924 1447 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 A8MXQ7 604 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 EBAG9O00559 213 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 GGPS1O95749 300 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 RFC5P40937 340 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 ALDH1A3P47895 512 aa7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SORCS1-209ENST00000612154 PTK2BQ14289 1009 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms