RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 ODR4Q5SWX8 454 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 KRT40Q6A162 431 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 RDM1Q8NG50 284 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 FAM20AQ96MK3 541 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 SCLT1Q96NL6 688 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 MAP7D2Q96T17 732 aa9.36□□□□□ -0.91
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PTPRM-214ENST00000583153 SQORQ9Y6N5 450 aa9.36□□□□□ -0.91
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PTPRM-214ENST00000583153 DLL1O00548 723 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 GPR182O15218 404 aa9.35□□□□□ -0.91
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PTPRM-214ENST00000583153 ZNF862O60290 1169 aa9.35□□□□□ -0.91
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PTPRM-214ENST00000583153 BANK1Q8NDB2 785 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 C8orf76Q96K31 380 aa9.35□□□□□ -0.91
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PTPRM-214ENST00000583153 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.35□□□□□ -0.91
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PTPRM-214ENST00000583153 DENND3A2RUS2 1198 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 FAM205CA6NFA0 338 aa9.34□□□□□ -0.91
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PTPRM-214ENST00000583153 RABEP1Q15276 862 aa9.34□□□□□ -0.91
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PTPRM-214ENST00000583153 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 NLRP7Q8WX94 980 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 KIF12Q96FN5 646 aa9.34□□□□□ -0.91
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PTPRM-214ENST00000583153 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.34□□□□□ -0.91
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PTPRM-214ENST00000583153 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 TTC3P53804 2025 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM150BA6NC51 233 aa9.33□□□□□ -0.92
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PTPRM-214ENST00000583153 TXKP42681 527 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 CYP4A11Q02928 519 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 ST3GAL1Q11201 340 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 PPP2R5CQ13362 524 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 EPHA7Q15375 998 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 TPH2Q8IWU9 490 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 IL27Q8NEV9 243 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 HAS1Q92839 578 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF25Q93038 417 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-214ENST00000583153 SAMD11Q96NU1 681 aa9.33□□□□□ -0.92
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