RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 FOXE3Q13461 319 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 FXNQ16595 210 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ALFQ53S48 1182 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SPECC1Q5M775 1068 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD45Q5TZF3 282 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 C11orf74Q86VG3 221 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 CHST12Q9NRB3 414 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 GULP1Q9UBP9 304 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 NKX3-2P78367 333 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 GPSM2P81274 684 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 DPTQ07507 201 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 COX10Q12887 443 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 PPP2R5DQ14738 602 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 COBLL1Q53SF7 1204 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 MIIPQ5JXC2 388 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 HYIQ5T013 277 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.52□□□□□ -1.85
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