RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 GATMP50440 423 aa23.63■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 NPY5RQ15761 445 aa23.63■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 UGCGQ16739 394 aa23.63■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 INF2Q27J81 1249 aa23.63■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.63■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.63■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 ADAM2Q99965 735 aa23.63■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.63■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 PFKFB2O60825 505 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 GPR32O75388 356 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 PSMD10O75832 226 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 XBP1P17861 261 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 CYP3A7P24462 503 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 PLVAPQ9BX97 442 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 ANAPC15P60006 121 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 LETM2Q2VYF4 491 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 LEXMQ3ZCV2 418 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 FAM228AQ86W67 206 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 RDM1Q8NG50 284 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 RGS18Q9NS28 235 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.61■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 STK36Q9NRP7 1315 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 AK2P54819 239 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD1Q15327 319 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 SCLT1Q96NL6 688 aa23.6■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 H3BQ06 376 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 MTERF2Q49AM1 385 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 MBOAT7Q96N66 472 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 CLDND1Q9NY35 253 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 MUC3AQ02505 3323 aa23.59■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 SLC37A4O43826 429 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 P2RX5Q93086 422 aa23.58■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PPP4C-211ENST00000567642 C9IYK1 514 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 MMP1P03956 469 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 XKR3Q5GH77 459 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 NEK8Q86SG6 692 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 NECAB1Q8N987 351 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 IGFLR1Q9H665 355 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.57■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM150BA6NC51 233 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 MARCH6O60337 910 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 CTDNEP1O95476 244 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 ITGB1P05556 798 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 IL9P15248 144 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 GPC3P51654 580 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 NEK9Q8TD19 979 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 OXER1Q8TDS5 423 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 NLRP7Q8WX94 980 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 WASF1Q92558 559 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 BDP1A6H8Y1 2624 aa23.56■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 NCK2O43639 380 aa23.55■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 DSC3Q14574 896 aa23.55■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.55■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.55■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.55■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 FGFR1P11362 822 aa23.54■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 HYAL1Q12794 435 aa23.54■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 POF1BQ8WVV4 589 aa23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms