RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 EMSYQ7Z589 1322 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 MGAMO43451 1857 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 ATP4AP20648 1035 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 IRF5Q13568 498 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 ALCAMQ13740 583 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 KIFAP3Q92845 792 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 K7ENM7 598 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 TPM2P07951 284 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 CYP2B6P20813 491 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 KRT31Q15323 416 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 PPME1Q9Y570 386 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 A0A1B0GTH6 734 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-208ENST00000566637 RFC5P40937 340 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 SLC26A2P50443 739 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 TMC6Q7Z403 805 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 PPTC7Q8NI37 304 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 FIZ1Q96SL8 496 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 GJD2Q9UKL4 321 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 EMC2Q15006 297 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 CEP63Q96MT8 703 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 PDXKO00764 312 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 N4BP3O15049 544 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 SMPD1P17405 629 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 PSMC4P43686 418 aa22.68■■□□□ 1.22
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CTU2-208ENST00000566637 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 TRIM50Q86XT4 487 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 VSTM4Q8IW00 320 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 INTS13Q9NVM9 706 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 MARK3P27448 753 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 SMTNP53814 917 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 PEX3P56589 373 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 TNFAIP2Q03169 654 aa22.68■■□□□ 1.22
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CTU2-208ENST00000566637 NR1I3Q14994 352 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 CCL14Q16627 93 aa22.68■■□□□ 1.22
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CTU2-208ENST00000566637 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 VPS16Q9H269 839 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 HOXD13P35453 343 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 RTP1P59025 263 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 AFG1LQ8WV93 481 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 IFT74Q96LB3 600 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-208ENST00000566637 CCDC169A6NNP5 214 aa22.66■■□□□ 1.22
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