RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 MYLIPQ8WY64 445 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 C16orf92Q96LL3 132 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 SGSM2O43147 1006 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 EFEMP2O95967 443 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 VCAM1P19320 739 aa7.62□□□□□ -1.19
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TMOD3-208ENST00000560725 SCAND1P57086 179 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 MLC1Q15049 377 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.62□□□□□ -1.19
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TMOD3-208ENST00000560725 E2F7Q96AV8 911 aa7.62□□□□□ -1.19
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TMOD3-208ENST00000560725 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 MSRAQ9UJ68 235 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 MAP3K1Q13233 1512 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 PZPP20742 1482 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.62□□□□□ -1.19
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TMOD3-208ENST00000560725 MED26O95402 600 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 LTFP02788 710 aa7.61□□□□□ -1.19
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TMOD3-208ENST00000560725 NR1I3Q14994 352 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.61□□□□□ -1.191e-13■■■■■ 32.3
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TMOD3-208ENST00000560725 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.61□□□□□ -1.19
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TMOD3-208ENST00000560725 ARHGEF5Q12774 1597 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-208ENST00000560725 NLRP1Q9C000 1473 aa7.61□□□□□ -1.19
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TMOD3-208ENST00000560725 CPS1P31327 1500 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-208ENST00000560725 MED14O60244 1454 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-208ENST00000560725 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-208ENST00000560725 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-208ENST00000560725 RASSF10A6NK89 507 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-208ENST00000560725 PLIN1O60240 522 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-208ENST00000560725 MPOP05164 745 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-208ENST00000560725 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-208ENST00000560725 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM253P0C7T8 217 aa7.58□□□□□ -1.2
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