RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, human

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTAB-208	ENST00000550718	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
GNPTAB-208	ENST00000550718	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	MRI	Q9BWK5	157 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	SLC26A4	O43511	780 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	ACRV1	P26436	265 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	SUV39H1	O43463	412 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	FOXL1	Q12952	345 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	NRN1L	Q496H8	165 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	GPR135	Q8IZ08	494 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	PLSCR1	O15162	318 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	LILRB2	Q8N423	598 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	RABGGTA	Q92696	567 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	EXTL1	Q92935	676 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	ACSS2	Q9NR19	701 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	IGFALS	P35858	605 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	STAT5B	P51692	787 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	HHEX	Q03014	270 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	PTH1R	Q03431	593 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	GRM7	Q14831	915 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	NFE2L2	Q16236	605 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	AMER2	Q8N7J2	671 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	PRL	P01236	227 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	ASL	P04424	464 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	CYP17A1	P05093	508 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	ROM1	Q03395	351 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	NME9	Q86XW9	330 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	CHST14	Q8NCH0	376 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	IL17D	Q8TAD2	202 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GNPTAB-208	ENST00000550718	CYP27B1	O15528	508 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	MAML3	Q96JK9	1138 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	ADCY7	P51828	1080 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	ABHD18	Q0P651	414 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	KLF10	Q13118	480 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	RIN1	Q13671	783 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	TLR9	Q9NR96	1032 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718		M0R2C6	588 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	ZNF202	O95125	648 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	RAPGEF3	O95398	923 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	MCM7	P33993	719 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	KIF11	P52732	1056 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	DGKD	Q16760	1214 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	C16orf92	Q96LL3	132 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	CABP5	Q9NP86	173 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	DVL2	O14641	736 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	RFPL3	O75679	317 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	ADAM15	Q13444	863 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	EPHA7	Q15375	998 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	TTC38	Q5R3I4	469 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GNPTAB-208	ENST00000550718	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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