RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM49P0CI25 452 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM49CP0CI26 452 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 GBP3Q9H0R5 595 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 PNMA2Q9UL42 364 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 AKR1B10O60218 316 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 KIF11P52732 1056 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 KRT76Q01546 638 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 LBX2Q6XYB7 198 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 KCND2Q9NZV8 630 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 HGSNATQ68CP4 663 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 C4orf19Q8IY42 314 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 GPRASP2Q96D09 838 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 EPHX2P34913 555 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 JAK3P52333 1124 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 BORCS6Q96GS4 357 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 CEP72Q9P209 647 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 PON1P27169 355 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 KRT83P78385 493 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 CEP170P1Q96L14 293 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 STRA6Q9BX79 667 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 GANQ9H2C0 597 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 CENPFP49454 3210 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 CTAGE9A4FU28 777 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC169A6NNP5 214 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 PPP1R37O75864 691 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 SPA17Q15506 151 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 MYH11P35749 1972 aa22.95■■□□□ 1.27
PRDM4-205ENST00000550376 EXOC3O60645 756 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 PGK2P07205 417 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 POTEJP0CG39 1038 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 PLS3P13797 630 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 SFNP31947 248 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 ACTR2P61160 394 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 Q3C1V9 767 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 96.1
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PRDM4-205ENST00000550376 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 CDK17Q00537 523 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 USP20Q9Y2K6 914 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 SRGAP2O75044 1071 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 LRRN2O75325 713 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 LYPLA2O95372 231 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 DLG4P78352 724 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 CBWD6Q4V339 395 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 BSNDQ8WZ55 320 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 GCNT4Q9P109 453 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM4-205ENST00000550376 UCHL3P15374 230 aa22.94■■□□□ 1.26
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