RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523334.1

HDAC2-215, Transcript of histone deacetylase 2, human

TSL 2

Gene HDAC2, Length 4,810 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC2-215	ENST00000523334	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.25	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		4.25	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.25	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.25	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.25	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CNTNAP1	P78357	1384 aa		4.25	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ITGB5	P18084	799 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	TNNI1	P19237	187 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ABCD1	P33897	745 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PBX1	P40424	430 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	KLK7	P49862	253 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	OAZ1	P54368	228 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ERVK-24	P63145	666 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	NEDD9	Q14511	834 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC102A	Q96A19	550 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	FAM212A	Q96EL1	285 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PNMA3	Q9UL41	463 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	UBE4B	O95155	1302 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	FZD9	O00144	591 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	BUB1	O43683	1085 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	DGAT1	O75907	488 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	COPB2	P35606	906 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	NPEPPS	P55786	919 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ERO1B	Q86YB8	467 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	TRPC6	Q9Y210	931 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	STAM2	O75886	525 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	GFPT2	O94808	682 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	KRT5	P13647	590 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PLS3	P13797	630 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	GUCY2C	P25092	1073 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CETN2	P41208	172 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	HSD17B4	P51659	736 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PGM5	Q15124	567 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	KLRG1	Q96E93	195 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.24	□□□□□ -1.73	1e-10	■■■■■ 141.6
HDAC2-215	ENST00000523334	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PFAS	O15067	1338 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334		K7ERI5	159 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ERLIN2	O94905	339 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	RARRES1	P49788	294 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	LENG9	Q96B70	501 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HDAC2-215	ENST00000523334	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73

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