RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	SOD2	P04179	222 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	GRK2	P25098	689 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	GRK3	P35626	688 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	SELENOP	P49908	381 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	LSAMP	Q13449	338 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	STAT4	Q14765	748 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	MLC1	Q15049	377 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	HS1BP3	Q53T59	392 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	PASD1	Q8IV76	773 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	TTC8	Q8TAM2	541 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM209	Q96SK2	561 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	ALG1	Q9BT22	464 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	IPPK	Q9H8X2	491 aa		5.1	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	E2F8	A0AVK6	867 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	PATE3	B3GLJ2	98 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702		H7BY64	318 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	CBX4	O00257	560 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	FLT3	P36888	993 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	TGFB2	P61812	414 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	NFATC3	Q12968	1075 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	DHCR24	Q15392	516 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	CFAP100	Q494V2	611 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF18B	Q86Y91	864 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	USP7	Q93009	1102 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	CDH19	Q9H159	772 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	CHST12	Q9NRB3	414 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	DTL	Q9NZJ0	730 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		5.09	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC189	A1A4V9	331 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR39	O43194	453 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	BRINP1	O60477	761 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	BPI	P17213	487 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	STEAP3	Q658P3	488 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702		Q8TCH9	128 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	COG1	Q8WTW3	980 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	IL17RA	Q96F46	866 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	WNK4	Q96J92	1243 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPN18	Q99952	460 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	CBLC	Q9ULV8	474 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		5.08	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC66	A2RUB6	948 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702		M0R2C6	588 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAF5	O00463	557 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PYGM	P11217	842 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	DSG1	Q02413	1049 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	KLF10	Q13118	480 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM177	Q53S58	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	CNTD1	Q8N815	330 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXW5	Q969U6	566 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TTC1	Q99614	292 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	CLDND1	Q9NY35	253 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6

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