RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 PPM1BO75688 479 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 CLSTN1O94985 981 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 JDP2Q8WYK2 163 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 MAST3O60307 1309 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 COL4A1P02462 1669 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 PSME4Q14997 1843 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 GDF11O95390 407 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 BAG3O95817 575 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ITGA4P13612 1032 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 PDE6AP16499 860 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 GNAT2P19087 354 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 KLRK1P26718 216 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ADD2P35612 726 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
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HERC3-210ENST00000512194 NIM1KQ8IY84 436 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 GP6Q9HCN6 339 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 TMEM260Q9NX78 707 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 PGAP2Q9UHJ9 254 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 SPEF2Q9C093 1822 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 CCDC171Q6TFL3 1326 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ZNF532Q9HCE3 1301 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ECE2O60344 883 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 NFIAQ12857 509 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 AOC3Q16853 763 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.59□□□□□ -1.03
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HERC3-210ENST00000512194 HOMER1Q86YM7 354 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-210ENST00000512194 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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HERC3-210ENST00000512194 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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HERC3-210ENST00000512194 ITGB2P05107 769 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-210ENST00000512194 ANAPC15P60006 121 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 CXCL9Q07325 125 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 NOGQ13253 232 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 TNIP1Q15025 636 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-210ENST00000512194 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-210ENST00000512194 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-210ENST00000512194 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 DBNDD1Q9H9R9 158 aa8.58□□□□□ -1.04
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HERC3-210ENST00000512194 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 CEP290O15078 2479 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PQU0 124 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 FAM170BA6NMN3 283 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 GPAA1O43292 621 aa8.57□□□□□ -1.04
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