RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509677.5

SH3BP2-214, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-214ENST00000509677 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 CEP89Q96ST8 783 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 M0QZ92 97 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 FOSL2P15408 326 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 RPA1P27694 616 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 TMOD1P28289 359 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 CDC25AP30304 524 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 MGAT3Q09327 533 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 POTEGQ6S5H5 508 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 NME8Q8N427 588 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 USP28Q96RU2 1077 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 MAP7D2Q96T17 732 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 AKT3Q9Y243 479 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 GINS2Q9Y248 185 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 F13A1P00488 732 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 CXCL10P02778 98 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 VTNP04004 478 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 GHRP10912 638 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 KRT79Q5XKE5 535 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 STK24Q9Y6E0 443 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 ZBBXA8MT70 800 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 ACTN1P12814 892 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 DRP2Q13474 957 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 PTPAQ15257 358 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 ECM1Q16610 540 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 HERVK_113Q902F9 699 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 NACC1Q96RE7 527 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-214ENST00000509677 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 DNM2P50570 870 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 GRIN1Q05586 938 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 KIZQ2M2Z5 673 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 PPME1Q9Y570 386 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 SCN5AQ14524 2016 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 RFC5P40937 340 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 RARRES1P49788 294 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 LPIN1Q14693 890 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 TCTN1Q2MV58 587 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 SEPT8Q92599 483 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 WDR81Q562E7 1941 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 BRD1O95696 1058 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 MUTP22033 750 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 EMC2Q15006 297 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 STK38Q15208 465 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 RASIP1Q5U651 963 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 TMEM143Q96AN5 459 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 AK8Q96MA6 479 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 SCLT1Q96NL6 688 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 OSMRQ99650 979 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 TET1Q8NFU7 2136 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 GPR32O75388 356 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 DNAJB2P25686 324 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-214ENST00000509677 SLC39A14Q15043 492 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms