RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496910.1

EXOSC3-208, Transcript of exosome component 3, human

TSL 2

Gene EXOSC3, Length 217 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EXOSC3-208	ENST00000496910	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	PLCH2	O75038	1416 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	HRK	O00198	91 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	BIN1	O00499	593 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	SGSM2	O43147	1006 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MYO1B	O43795	1136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	AMY2A	P04746	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	AMY2B	P19961	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	PAK1	Q13153	545 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MTMR1	Q13613	665 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MORC3	Q14149	939 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	KCNK12	Q9HB15	430 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	F2	P00734	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	ASL	P04424	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	COL6A1	P12109	1028 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	CNTNAP1	P78357	1384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	TRAF5	O00463	557 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	KRT38	O76015	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	PYGM	P11217	842 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	NAT1	P18440	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	VIPR1	P32241	457 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MAN1A1	P33908	653 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	IGFALS	P35858	605 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	ARL4A	P40617	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MRE11	P49959	708 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	NEK3	P51956	506 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	MESP2	Q0VG99	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EXOSC3-208	ENST00000496910	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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