RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	CNTNAP1	P78357	1384 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATG4A-208	ENST00000489247	SIPA1L1	O43166	1804 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMD14	O00487	310 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	TM4SF5	O14894	197 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB5	O15062	677 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAMTS3	O15072	1205 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC26A4	O43511	780 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	PLA2G6	O60733	806 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	MYL1	P05976	194 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	TCF3	P15923	654 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	TXK	P42681	527 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	GATA4	P43694	442 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	GRIA4	P48058	902 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF75D	P51815	510 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	MORC3	Q14149	939 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	POSTN	Q15063	836 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	MCTP2	Q6DN12	878 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	MLKL	Q8NB16	471 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	CNNM3	Q8NE01	707 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	MBOAT7	Q96N66	472 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	PIGS	Q96S52	555 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	MUC3B	Q9H195	1237 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	GINM1	Q9NU53	330 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	SOX13	Q9UN79	622 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	AK5	Q9Y6K8	562 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A087X0B3	334 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	SMCO2	A6NFE2	343 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	SMTNL1	A8MU46	457 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	DLL1	O00548	723 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	EDIL3	O43854	480 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	BMP6	P22004	513 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	POLD1	P28340	1107 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	NAPA	P54920	295 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	ICA1	Q05084	483 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	LRP8	Q14114	963 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	DLGAP5	Q15398	846 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF174	Q15697	407 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	IL17A	Q16552	155 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	USP49	Q70CQ1	688 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	NEK8	Q86SG6	692 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	CCNJL	Q8IV13	435 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	NIM1K	Q8IY84	436 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	IQUB	Q8NA54	791 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	DPF2	Q92785	391 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	GSDMA	Q96QA5	445 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	MTMR9	Q96QG7	549 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	CUEDC2	Q9H467	287 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	MYH1	P12882	1939 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	FSCN2	O14926	492 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41

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