RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476985.5

PARP11-208, Transcript of poly(ADP-ribose) polymerase family member 11, human

TSL 3

Gene PARP11, Length 591 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARP11-208	ENST00000476985	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985		Q9UFV3	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	NPTXR	O95502	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	MPIG6B	O95866	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	MRE11	P49959	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	STAT5B	P51692	787 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985		B4E1Z4	1266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985		M0R2C6	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	OPA1	O60313	960 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	HSD3B2	P26439	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	STIL	Q15468	1287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	TBR1	Q16650	682 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	ENPP3	O14638	875 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	PLD2	O14939	933 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	RAD17	O75943	681 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	IGFALS	P35858	605 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	KIF11	P52732	1056 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARP11-208	ENST00000476985	SDHA	P31040	664 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	HHEX	Q03014	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	ZNF174	Q15697	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	DLG3	Q92796	817 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985		H7C1D1	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	MATN2	O00339	956 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	KCNQ2	O43526	872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	KCNA6	P17658	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	FLT3	P36888	993 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	ROM1	Q03395	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	ADAM15	Q13444	863 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	FOXE3	Q13461	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	NFYC	Q13952	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	CDC45	O75419	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	ASL	P04424	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	RGS3	P49796	1198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	ZNF460	Q14592	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	GRM7	Q14831	915 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARP11-208	ENST00000476985	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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