RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.03■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 ADCY3O60266 1144 aa20.02■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MMP3P08254 477 aa20.02■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 CYBAP13498 195 aa20.02■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 DRP2Q13474 957 aa20.02■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM143Q96AN5 459 aa20.02■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.02■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ATG4B-217ENST00000475693 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 IGBP1P78318 339 aa20.02■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.02■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 CEP89Q96ST8 783 aa20.02■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.02■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.02■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.02■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.01■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PGK1P00558 417 aa20.01■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.01■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 RAET1EQ8TD07 263 aa20.01■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 BSNDQ8WZ55 320 aa20.01■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 TRPC6Q9Y210 931 aa20.01■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 UQCRHP07919 91 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 GUCY2CP25092 1073 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 ODR4Q5SWX8 454 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 SCFD1Q8WVM8 642 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 FIZ1Q96SL8 496 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PARVGQ9HBI0 331 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 HOXD13P35453 343 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PTPN21Q16825 1174 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD40Q6AI12 368 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PDLIM7Q9NR12 457 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM17Q9Y577 477 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 GJB1P08034 283 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PEX3P56589 373 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 MYL5Q02045 173 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PAK1Q13153 545 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC71Q8N4P6 559 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 BEGAINQ9BUH8 593 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 NRBP2Q9NSY0 501 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 THSD7BQ9C0I4 1608 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 EMSYQ7Z589 1322 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 H3BRB1 525 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PPFIA4O75335 1185 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 GCNT3O95395 438 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PTMAP06454 111 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 CREBRFQ8IUR6 639 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 ATP8B4Q8TF62 1192 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 SUGCTQ9HAC7 445 aa19.99■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 AKR1A1P14550 325 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF131P52739 623 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 EMC2Q15006 297 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 ERO1AQ96HE7 468 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 DACH1Q9UI36 760 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 A6NJR5 290 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 CAVIN2O95810 425 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 INSRRP14616 1297 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 DGKDQ16760 1214 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 SAGE1Q9NXZ1 904 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 ERAP1Q9NZ08 941 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 USP20Q9Y2K6 914 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 SLC16A4O15374 487 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 MYL3P08590 195 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 HOXD10P28358 340 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 PSMD2Q13200 908 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 FAM178BQ8IXR5 827 aa19.97■□□□□ 0.79
ATG4B-217ENST00000475693 MYOCDQ8IZQ8 938 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms