RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 IFT57Q9NWB7 429 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-204ENST00000461653 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-204ENST00000461653 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-204ENST00000461653 CD83Q01151 205 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-204ENST00000461653 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-204ENST00000461653 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-204ENST00000461653 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-204ENST00000461653 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-204ENST00000461653 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-204ENST00000461653 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-204ENST00000461653 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-204ENST00000461653 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM89AQ96GI7 184 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.22□□□□□ -1.41
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