RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445181.5

C9orf3-207, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 873 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-207ENST00000445181 USP38Q8NB14 1042 aa26.8■■□□□ 1.88
C9orf3-207ENST00000445181 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.8■■□□□ 1.88
C9orf3-207ENST00000445181 ERMNQ8TAM6 284 aa26.8■■□□□ 1.88
C9orf3-207ENST00000445181 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.8■■□□□ 1.88
C9orf3-207ENST00000445181 TRPV2Q9Y5S1 764 aa26.8■■□□□ 1.88
C9orf3-207ENST00000445181 EVPLQ92817 2033 aa26.79■■□□□ 1.88
C9orf3-207ENST00000445181 STX6O43752 255 aa26.79■■□□□ 1.88
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C9orf3-207ENST00000445181 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa26.79■■□□□ 1.88
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C9orf3-207ENST00000445181 SEPT8Q92599 483 aa26.79■■□□□ 1.88
C9orf3-207ENST00000445181 CEP170P1Q96L14 293 aa26.79■■□□□ 1.88
C9orf3-207ENST00000445181 MAP7D2Q96T17 732 aa26.79■■□□□ 1.88
C9orf3-207ENST00000445181 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.79■■□□□ 1.88
C9orf3-207ENST00000445181 RAB34Q9BZG1 259 aa26.79■■□□□ 1.88
C9orf3-207ENST00000445181 CERS4Q9HA82 394 aa26.79■■□□□ 1.88
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C9orf3-207ENST00000445181 GINS2Q9Y248 185 aa26.79■■□□□ 1.88
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C9orf3-207ENST00000445181 OSBPL7Q9BZF2 842 aa26.78■■□□□ 1.88
C9orf3-207ENST00000445181 CYP26B1Q9NR63 512 aa26.78■■□□□ 1.88
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C9orf3-207ENST00000445181 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
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C9orf3-207ENST00000445181 DNM2P50570 870 aa26.76■■□□□ 1.87
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C9orf3-207ENST00000445181 XKR9Q5GH70 373 aa26.76■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.76■■□□□ 1.87
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C9orf3-207ENST00000445181 LPIN1Q14693 890 aa26.75■■□□□ 1.87
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C9orf3-207ENST00000445181 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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C9orf3-207ENST00000445181 APBB2Q92870 758 aa26.74■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 SCLT1Q96NL6 688 aa26.74■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 CEP89Q96ST8 783 aa26.74■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 A0A0C4DFX4 3053 aa26.74■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa26.73■■□□□ 1.87
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C9orf3-207ENST00000445181 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.73■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 LINC01465Q8N7H1 131 aa26.73■■□□□ 1.87
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C9orf3-207ENST00000445181 CHD7Q9P2D1 2997 aa26.72■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 EYSQ5T1H1 3165 aa26.72■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 EPOPA6NHQ4 379 aa26.72■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 BMP15O95972 392 aa26.72■■□□□ 1.87
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C9orf3-207ENST00000445181 CD52P31358 61 aa26.72■■□□□ 1.87
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C9orf3-207ENST00000445181 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.72■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.72■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 PRDM6Q9NQX0 595 aa26.72■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 ANKEF1Q9NU02 776 aa26.72■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 SQORQ9Y6N5 450 aa26.72■■□□□ 1.87
C9orf3-207ENST00000445181 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa26.71■■□□□ 1.87
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