RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 WDR11Q9BZH6 1224 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 KCND2Q9NZV8 630 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 ODF2LQ9ULJ1 636 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 UBE4BO95155 1302 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP17.48■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 27.3
SHQ1-202ENST00000444040 KIF4AO95239 1232 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 IFT20Q8IY31 132 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 DEFB129Q9H1M3 183 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 NNTQ13423 1086 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 DLGAP5Q15398 846 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 RPS6KA1Q15418 735 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 LDHDQ86WU2 507 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 FAM178BQ8IXR5 827 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 GOLPH3Q9H4A6 298 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 EHMT1Q9H9B1 1298 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.48■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 PSME4Q14997 1843 aa17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 FMO5P49326 533 aa17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 CARSP49589 748 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 SETQ01105 290 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 FAM160B2Q86V87 743 aa17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 TPCN2Q8NHX9 752 aa17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 KRT12Q99456 494 aa17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 STRA6Q9BX79 667 aa17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 EPB41L5Q9HCM4 733 aa17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 TBC1D12O60347 775 aa17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 RAD17O75943 681 aa17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 FERP16591 822 aa17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 GUCY2CP25092 1073 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 STAT1P42224 750 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 NOP2P46087 812 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 MAPK7Q13164 816 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 ODR4Q5SWX8 454 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 LRRC31Q6UY01 552 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 SLFN11Q7Z7L1 901 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 SLC30A5Q8TAD4 765 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 LXNQ9BS40 222 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 TEKT3Q9BXF9 490 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 INTUQ9ULD6 942 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 KCNK3O14649 394 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 EVI5O60447 810 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 PPP1R37O75864 691 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 GFPT2O94808 682 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 H2AFZP0C0S5 128 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 GUCY2DQ02846 1103 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 CBWD6Q4V339 395 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 CBWD3Q5JTY5 395 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 CBWD5Q5RIA9 395 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 ALS2CLQ60I27 953 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 H2AFVQ71UI9 128 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 HS2ST1Q7LGA3 356 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 VPS36Q86VN1 386 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 DAW1Q8N136 415 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 TAF4BQ92750 862 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 MXRA8Q9BRK3 442 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM39BQ9GZU3 492 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 FEM1BQ9UK73 627 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 NFU1Q9UMS0 254 aa17.46■□□□□ 0.39
SHQ1-202ENST00000444040 ESYT3A0FGR9 886 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 F8VZ95 297 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 CAP2P40123 477 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 PBKQ96KB5 322 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 RIT2Q99578 217 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 STK33Q9BYT3 514 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 GPR88Q9GZN0 384 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA6CA6NDK9 693 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 TULP2O00295 520 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 FAM153BP0C7A2 387 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA6DP0CG33 693 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 ITGB5P18084 799 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 SOX5P35711 763 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 HSD17B4P51659 736 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 FAM153CQ494X1 144 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 MIGA2Q7L4E1 593 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 BANK1Q8NDB2 785 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 ACTRT1Q8TDG2 376 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 SCFD2Q8WU76 684 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 SYT11Q9BT88 431 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 FAM153AQ9UHL3 310 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa17.45■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 IVLP07476 585 aa17.44■□□□□ 0.38
SHQ1-202ENST00000444040 PTGER2P43116 358 aa17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms