RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RIC3Q7Z5B4 369 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TCP11L2Q8N4U5 519 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PGBD4Q96DM1 585 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PHACTR3Q96KR7 559 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CNBD2Q96M20 576 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 ERICH5Q6P6B1 374 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 TMEM206Q9H813 350 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 STX8Q9UNK0 236 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PQ72 361 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP69A5D8W1 941 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GNPATO15228 680 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 NBNO60934 754 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 RRN3Q9NYV6 651 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MBD2Q9UBB5 411 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RTL1A6NKG5 1358 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB39O15060 712 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 NMT2O60551 498 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CCT8P50990 548 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ITGA9Q13797 1035 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 RASA4O43374 803 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 RGS20O76081 388 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 FGFR2P21802 821 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 JAK1P23458 1154 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 IL12RB1P42701 662 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 INPP1P49441 399 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 TRIM14Q14142 442 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PCSK7Q16549 785 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 DEPDC1Q5TB30 811 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PEX26Q7Z412 305 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 HINFPQ9BQA5 517 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 HAUS4Q9H6D7 363 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 KIF24Q5T7B8 1368 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ERCC6Q03468 1493 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP99D6REC4 459 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PI4K2BG5E9Z4 385 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GABBR2O75899 941 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 KCNJ6P48051 423 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GNAQP50148 359 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 GNG2P59768 71 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 BPIFB4P59827 614 aa5.97□□□□□ -1.45
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