RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439576.6

ACAN-202, Transcript of aggrecan, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene ACAN, Length 8,840 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAN-202ENST00000439576 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.93□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.93□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 GGA1Q9UJY5 639 aa14.93□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.93□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 ADCY9O60503 1353 aa14.93□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.93□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 TECP42680 631 aa14.93□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.93□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.93□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 USE1Q9NZ43 259 aa14.93□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 NFU1Q9UMS0 254 aa14.93□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 FAM161BQ96MY7 647 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 WWP1Q9H0M0 922 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 CCND1P24385 295 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 SARM1Q6SZW1 724 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 ABI1Q8IZP0 508 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 HIPK4Q8NE63 616 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 ACCSQ96QU6 501 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 WDR91A4D1P6 747 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 SLCO1A2P46721 670 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 CNBD1Q8NA66 436 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 LAMB3Q13751 1172 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 NAA35Q5VZE5 725 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 CDHR1Q96JP9 859 aa14.92□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 NUP107P57740 925 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 FAF2Q96CS3 445 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 PSMC6P62333 389 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 ZBED6P86452 979 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 ODR4Q5SWX8 454 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 DDI1Q8WTU0 396 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 VPS50Q96JG6 964 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 KCNA3P22001 575 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 LPIN2Q92539 896 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 NACC1Q96RE7 527 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 PIGUQ9H490 435 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 EYA2O00167 538 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 AHI1Q8N157 1196 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 C5orf58C9J3I9 102 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 TCIRG1Q13488 830 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 SKAP1Q86WV1 359 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.91□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 E7EWF7 191 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 SPATA5Q8NB90 893 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 CNPY3Q9BT09 278 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 EPC1Q9H2F5 836 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 SEMA3EO15041 775 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 KRT6AP02538 564 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 KRT6BP04259 564 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 KRT6CP48668 564 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 RBBP7Q16576 425 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 EME1Q96AY2 570 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 COX16Q9P0S2 106 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 NDUFA10O95299 355 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 NFIBO00712 420 aa14.9□□□□□ -0.02
ACAN-202ENST00000439576 KSR1Q8IVT5 923 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms