RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		7	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	PLD2	O14939	933 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	SUV39H1	O43463	412 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC26A4	O43511	780 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	ROM1	Q03395	351 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	JMY	Q8N9B5	988 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	EXTL1	Q92935	676 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	LPP	Q93052	612 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	CABP5	Q9NP86	173 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	VWA7	Q9Y334	891 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	RASSF10	A6NK89	507 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	RAPGEF3	O95398	923 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	FLT3	P36888	993 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	KIF11	P52732	1056 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	ABHD18	Q0P651	414 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	FOXL1	Q12952	345 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	D2HGDH	Q8N465	521 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	CFHR4	Q92496	578 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	FOXB1	Q99853	325 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283		M0R2C6	588 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	CYP27B1	O15528	508 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	OPA1	O60313	960 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	SLPI	P03973	132 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	IGFALS	P35858	605 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	FNTB	P49356	437 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	PTH1R	Q03431	593 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF174	Q15697	407 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	MIIP	Q5JXC2	388 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283		Q6ZSN1	163 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	ACSS2	Q9NR19	701 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	TLR9	Q9NR96	1032 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A1W2PRX2	142 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	CAPN14	A8MX76	684 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283		H7C1D1	291 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF202	O95125	648 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	KCNA6	P17658	529 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	ACRV1	P26436	265 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC6A3	Q01959	620 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	DUSP8	Q13202	625 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	ADAM15	Q13444	863 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	CHST14	Q8NCH0	376 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF503	Q96F45	646 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	ASL	P04424	464 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	MCM7	P33993	719 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	HGFAC	Q04756	655 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	CRHR2	Q13324	411 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	NME9	Q86XW9	330 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	GPR135	Q8IZ08	494 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	LILRB2	Q8N423	598 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	NACAD	O15069	1562 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	MAFG	O15525	162 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	CYP17A1	P05093	508 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	KLF10	Q13118	480 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	RIN1	Q13671	783 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	FHL2	Q14192	279 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	DGKD	Q16760	1214 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	TTC38	Q5R3I4	469 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PTPN4-204	ENST00000431283	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3

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