RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 EDAQ92838 391 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 APOL5Q9BWW9 433 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 C6orf50Q9HD87 102 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.91■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 C9IYK1 514 aa21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 PSAPP07602 524 aa21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 ERVFC1P60507 584 aa21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 UBE3AQ05086 875 aa21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 SCLT1Q96NL6 688 aa21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.9■■□□□ 1.1
UBXN4-202ENST00000415164 ADAMTS3O15072 1205 aa21.89■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 CA8P35219 290 aa21.89■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 ABI1Q8IZP0 508 aa21.89■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.89■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.89■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 PBXIP1Q96AQ6 731 aa21.89■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 MAP7D2Q96T17 732 aa21.89■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.89■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM221A6NGB7 291 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 M0R296 226 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 CYP3A4P08684 503 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 LAG3P18627 525 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 PBX3P40426 434 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 DUSP6Q16828 381 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 Q6ZUG5 572 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 TCF25Q9BQ70 676 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 KCNH6Q9H252 994 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.88■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 LOC730098B7Z3J9 87 aa21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 CHMP2AO43633 222 aa21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 GPR32O75388 356 aa21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 TMOD1P28289 359 aa21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 TECP42680 631 aa21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 BRF1Q92994 677 aa21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 PHKBQ93100 1093 aa21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 CWH43Q9H720 699 aa21.87■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 CDC45O75419 566 aa21.86■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 GNA11P29992 359 aa21.86■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB33Q86T24 672 aa21.86■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 FAM167AQ96KS9 214 aa21.86■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.86■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.86■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.85■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 MAGEB2O15479 319 aa21.85■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 HOXA2O43364 376 aa21.85■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 FGFR4P22455 802 aa21.85■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 ZXDAP98168 799 aa21.85■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 MCTP2Q6DN12 878 aa21.85■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 TMC7Q7Z402 723 aa21.85■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF558Q96NG5 402 aa21.85■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 ESYT2A0FGR8 921 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 FSD2A1L4K1 749 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 WDR64B1ANS9 1081 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 FSCN2O14926 492 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 RCAN1P53805 252 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 KRT17Q04695 432 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 DSC3Q14574 896 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC43Q8N309 656 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 NLRP7Q8WX94 980 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 CASD1Q96PB1 797 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 DISC1Q9NRI5 854 aa21.84■■□□□ 1.09
UBXN4-202ENST00000415164 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms