RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 KRT18P05783 430 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 CYP3A4P08684 503 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 MDH1P40925 334 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 OGFOD1Q8N543 542 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 FAM133AQ8N9E0 248 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 CYP2W1Q8TAV3 490 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 COL4A5P29400 1685 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 USP8P40818 1118 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 ARID5AQ03989 594 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 KCNV1Q6PIU1 500 aa26.78■■□□□ 1.88
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FAAP20-206ENST00000414253 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 SCFD1Q8WVM8 642 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 ISCUQ9H1K1 167 aa26.78■■□□□ 1.88
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FAAP20-206ENST00000414253 POLD4Q9HCU8 107 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 GOPCQ9HD26 462 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 PLAAQ9Y263 795 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 MEIS1O00470 390 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 FSBPO95073 299 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 PLCB1Q9NQ66 1216 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 VAV3Q9UKW4 847 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 DNM3Q9UQ16 869 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 CAPN7Q9Y6W3 813 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 RPS6KA1Q15418 735 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 LRIG3Q6UXM1 1119 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 MAATS1Q7Z4T9 603 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 KLHL7Q8IXQ5 586 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 KCTD10Q9H3F6 313 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 TMBIM4Q9HC24 238 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-206ENST00000414253 ZBTB7AO95365 584 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF76P36508 570 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 FNTAP49354 379 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.872e-7■■■□□ 17.4
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FAAP20-206ENST00000414253 C10orf76Q5T2E6 689 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 STK24Q9Y6E0 443 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 NLRP14Q86W24 1093 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 ZHX3Q9H4I2 956 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 VEZTQ9HBM0 779 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 KCNK3O14649 394 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 ERVK-9P63128 1117 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 TRAF1Q13077 416 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 GIT2Q14161 759 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.75■■□□□ 1.87
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FAAP20-206ENST00000414253 GOLGA6L10A6NI86 522 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 EPS15P42566 896 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 CUL1Q13616 776 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 SCFD2Q8WU76 684 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 KIF4AO95239 1232 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 CFBP00751 764 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 ECHS1P30084 290 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC174Q6PII3 467 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 GGA2Q9UJY4 613 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 ACTRT1Q8TDG2 376 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 FAM107AO95990 144 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 CYP4A11Q02928 519 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 REEP2Q9BRK0 252 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 EML1O00423 815 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 HSD17B3P37058 310 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 SEC24CP53992 1094 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 KCNH2Q12809 1159 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 ADAM9Q13443 819 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 TEX2Q8IWB9 1127 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC45Q96CN5 670 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 VCPKMTQ9H867 229 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 H0YHG0 523 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 TBC1D12O60347 775 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 MYZAPP0CAP1 466 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-206ENST00000414253 CASP5P51878 434 aa26.71■■□□□ 1.87
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