RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 JAK3P52333 1124 aa25.38■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 ANAPC15P60006 121 aa25.38■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 TIGD5Q53EQ6 642 aa25.38■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.38■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 ADAM2Q99965 735 aa25.38■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 STK36Q9NRP7 1315 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM150BA6NC51 233 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 MAGEB2O15479 319 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 STBD1O95210 358 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 STAG3L1P0CL83 205 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 SARSP49591 514 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 OXER1Q8TDS5 423 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 ADAMTS10Q9H324 1103 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 RGS18Q9NS28 235 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 NRBP2Q9NSY0 501 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.37■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 BDP1A6H8Y1 2624 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 GPR182O15218 404 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 CDKL5O76039 1030 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 CSPG5O95196 566 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 LARGE1O95461 756 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 CAMK1Q14012 370 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 NECAB1Q8N987 351 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 LRFN2Q9ULH4 789 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 AKT3Q9Y243 479 aa25.36■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 C9IYK1 514 aa25.35■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 DRP2Q13474 957 aa25.35■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 DSC3Q14574 896 aa25.35■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 ME3Q16798 604 aa25.35■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 LETM2Q2VYF4 491 aa25.35■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 LEXMQ3ZCV2 418 aa25.35■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 FAM102BQ5T8I3 360 aa25.35■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 CEP89Q96ST8 783 aa25.35■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.35■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa25.35■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 DENND3A2RUS2 1198 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 SEC24BO95487 1268 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 DNAJB1P25685 340 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 RDM1Q8NG50 284 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 MAP7D2Q96T17 732 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 PLVAPQ9BX97 442 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 LMAN2LQ9H0V9 348 aa25.34■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 H3BQ06 376 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 EML1O00423 815 aa25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 ITGB1P05556 798 aa25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 COL19A1Q14993 1142 aa25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 ODR4Q5SWX8 454 aa25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 SLC24A5Q71RS6 500 aa25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 NEK9Q8TD19 979 aa25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 C1orf112Q9NSG2 853 aa25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 HCSTQ9UBK5 93 aa25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
KDELR3-202ENST00000409006 FAM205CA6NFA0 338 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 MMP1P03956 469 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 IL9P15248 144 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 TMOD1P28289 359 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 GPC3P51654 580 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 FAM189BP81408 668 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 ANKRD1Q15327 319 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 MTERF2Q49AM1 385 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 NEK8Q86SG6 692 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 KLHL23Q8NBE8 558 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 SPPL3Q8TCT6 385 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 P2RX5Q93086 422 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 CD320Q9NPF0 282 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 VAV3Q9UKW4 847 aa25.32■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 LTBRP36941 435 aa25.31■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 XKR3Q5GH77 459 aa25.31■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 EP400NLQ6ZTU2 488 aa25.31■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 TBKBP1A7MCY6 615 aa25.3■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 FGFR1P11362 822 aa25.3■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 XBP1P17861 261 aa25.3■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 FGFR4P22455 802 aa25.3■■□□□ 1.64
KDELR3-202ENST00000409006 HYAL1Q12794 435 aa25.3■■□□□ 1.64
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