RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 MYBPC3Q14896 1274 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP5.37□□□□□ -1.553e-45■■■■■ 92.7
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR72Q3MJ13 1102 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 IQSEC1Q6DN90 963 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 C7orf31Q8N865 590 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 COG1Q8WTW3 980 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 MYL10Q9BUA6 226 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 VTA1Q9NP79 307 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 NCANO14594 1321 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 B8ZZF3 427 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKD3O94806 890 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ADCY8P40145 1251 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ADCY2Q08462 1091 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 FAPQ12884 760 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 MOGSQ13724 837 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 PDCD1Q15116 288 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM168Q9H0V1 697 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 KDM1AO60341 852 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM13O60858 407 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 MAFO75444 373 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 APOL3O95236 402 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 POLD1P28340 1107 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNC1P48547 511 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 GUCY2FP51841 1108 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 NFATC3Q12968 1075 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 RGL3Q3MIN7 710 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1841Q6NSI8 718 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZUG5 572 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 SIAH1Q8IUQ4 282 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ANO3Q9BYT9 981 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM8Q9BZR9 551 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO10Q9UK96 956 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS38A1L453 326 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 C9orf118A6NHY6 69 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ALG1L2C9J202 215 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 BCAR1P56945 870 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ANAPC15P60006 121 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 IGBP1P78318 339 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 GRAMD4Q6IC98 578 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 OTOP2Q7RTS6 562 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 CMIPQ8IY22 773 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 MBD6Q96DN6 1003 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 AJUBAQ96IF1 538 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 KATNBL1Q9H079 304 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 KCMF1Q9P0J7 381 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNG1Q9UIX4 513 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGGTB-202ENST00000370826 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0G2JNJ9 132 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 K7ESF4 209 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 NOBOXO60393 691 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 CUTAO60888 179 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 BMP7P18075 431 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 ANTXR2P58335 489 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 CNTD1Q8N815 330 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 SYT8Q8NBV8 401 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 FERMT2Q96AC1 680 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 Q9UFV3 132 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAM29Q9UKF5 820 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 DENND2AQ9ULE3 1009 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 ZDHHC9Q9Y397 364 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms