RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ADAM8P78325 824 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 MMEP08473 750 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 KRT15P19012 456 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRC-202ENST00000367364 RABGGTBP53611 331 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRC-202ENST00000367364 GPR87Q9BY21 358 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-202ENST00000367364 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 GAREM2Q75VX8 874 aa6.71□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 WDR48Q8TAF3 677 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 FBXW5Q969U6 566 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 ST7Q9NRC1 585 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 ZAR1LA6NP61 321 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 TM4SF20Q53R12 229 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 HTR3DQ70Z44 454 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 CAPN10Q9HC96 672 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 COL4A3Q01955 1670 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 RASSF10A6NK89 507 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 DPH6Q7L8W6 267 aa6.68□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 LPPQ93052 612 aa6.68□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 ARVCFO00192 962 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 DDR2Q16832 855 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 PGBD4Q96DM1 585 aa6.67□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 AQP7O14520 342 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 ITGB1P05556 798 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 CRY1Q16526 586 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 SYNE4Q8N205 404 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 UBE2QL1A1L167 161 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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PTPRC-202ENST00000367364 ERBB2P04626 1255 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 FGRP09769 529 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRC-202ENST00000367364 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 BPIFB4P59827 614 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-202ENST00000367364 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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