RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

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Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TNFRSF25-201ENST00000348333 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.64■■□□□ 1.7
TNFRSF25-201ENST00000348333 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKRD1Q15327 319 aa25.63■■□□□ 1.69
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TNFRSF25-201ENST00000348333 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 NPAS4Q8IUM7 802 aa25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 HLA-CQ95604 372 aa25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.63■■□□□ 1.69
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TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.62■■□□□ 1.69
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TNFRSF25-201ENST00000348333 JAK2O60674 1132 aa25.62■■□□□ 1.69
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TNFRSF25-201ENST00000348333 FOSBP53539 338 aa25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 NR5A1Q13285 461 aa25.62■■□□□ 1.69
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TNFRSF25-201ENST00000348333 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 COG5Q9UP83 839 aa25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 AKT3Q9Y243 479 aa25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 GRM6O15303 877 aa25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 BMPR1AP36894 532 aa25.61■■□□□ 1.69
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TNFRSF25-201ENST00000348333 ADAMTS10Q9H324 1103 aa25.61■■□□□ 1.69
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TNFRSF25-201ENST00000348333 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
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TNFRSF25-201ENST00000348333 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.6■■□□□ 1.69
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TNFRSF25-201ENST00000348333 MTERF2Q49AM1 385 aa25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL27Q8NEV9 243 aa25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 RDM1Q8NG50 284 aa25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 TNFRSF25Q93038 417 aa25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF25-201ENST00000348333 TNFRSF10AO00220 468 aa25.59■■□□□ 1.69
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TNFRSF25-201ENST00000348333 C9IYK1 514 aa25.58■■□□□ 1.69
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TNFRSF25-201ENST00000348333 STAG3L1P0CL83 205 aa25.57■■□□□ 1.68
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TNFRSF25-201ENST00000348333 GPC3P51654 580 aa25.57■■□□□ 1.68
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TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.57■■□□□ 1.68
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TNFRSF25-201ENST00000348333 XKR3Q5GH77 459 aa25.56■■□□□ 1.68
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TNFRSF25-201ENST00000348333 DNAJB1P25685 340 aa25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMOD1P28289 359 aa25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF25-201ENST00000348333 CAMK1Q14012 370 aa25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC24A5Q71RS6 500 aa25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF25-201ENST00000348333 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM20AQ96MK3 541 aa25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF25-201ENST00000348333 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
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