RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342075.8

PMS1-201, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2

Gene PMS1, Length 3,012 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-201ENST00000342075 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 CCDC65Q8IXS2 484 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 MLKLQ8NB16 471 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 ANKEF1Q9NU02 776 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 FANCLQ9NW38 375 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 WBP1LQ9NX94 342 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 FAM184BQ9ULE4 1060 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 EMSYQ7Z589 1322 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 ODR4Q5SWX8 454 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 SAGE1Q9NXZ1 904 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 USP20Q9Y2K6 914 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 BECN2A8MW95 431 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 AKR1A1P14550 325 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 HOXD13P35453 343 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 OTUD6AQ7L8S5 288 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 SCFD1Q8WVM8 642 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 ERO1AQ96HE7 468 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 PPP1R16BQ96T49 567 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 SEMA6BQ9H3T3 888 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa15.38■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 KAT2BQ92831 832 aa15.37■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.37■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 SUGCTQ9HAC7 445 aa15.37■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 PARVGQ9HBI0 331 aa15.37■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.37■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 KAT6AQ92794 2004 aa15.37■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa15.37■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 GCNT3O95395 438 aa15.37■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 PEX3P56589 373 aa15.37■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 HIC1Q14526 733 aa15.37■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 ATP8B4Q8TF62 1192 aa15.37■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 A6NJR5 290 aa15.36■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 MYL3P08590 195 aa15.36■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 INSRRP14616 1297 aa15.36■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 MRE11P49959 708 aa15.36■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 ANKRD40Q6AI12 368 aa15.36■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa15.36■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 ERAP1Q9NZ08 941 aa15.36■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 SLC16A4O15374 487 aa15.36■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 ZNF131P52739 623 aa15.36■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 PAK1Q13153 545 aa15.36■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 MYL5Q02045 173 aa15.35■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 IRF5Q13568 498 aa15.35■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa15.35■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa15.35■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 HOXD10P28358 340 aa15.35■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
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PMS1-201ENST00000342075 FAM178BQ8IXR5 827 aa15.35■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 BPIFA3Q9BQP9 254 aa15.35■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 AP5M1Q9H0R1 490 aa15.35■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.35■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 SETD4Q9NVD3 440 aa15.35■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.34■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 K7ENM7 598 aa15.34■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa15.34■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 GNASQ5JWF2 1037 aa15.34■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.34■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 METTL13Q8N6R0 699 aa15.34■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.34■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 CCDC169A6NNP5 214 aa15.34■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
PMS1-201ENST00000342075 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.34■□□□□ 0.05
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