RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319331.3

LRRN1-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN1, Length 3,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1-201ENST00000319331 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 PLA2G12BQ9BX93 195 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 VCXQ9H320 206 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 TMEM120BA0PK00 339 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 CDK17Q00537 523 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ITIH3Q06033 890 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 SEPT14Q6ZU15 432 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 C18orf8Q96DM3 657 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 IKBKGQ9Y6K9 419 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 CRKLP46109 303 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 MTM1Q13496 603 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 BARGINQ6ZT62 677 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 JAMLQ86YT9 394 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 GAS8O95995 478 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 LMNB1P20700 586 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 FECHP22830 423 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 BTDP43251 543 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 FNTAP49354 379 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 KCNK18Q7Z418 384 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 CROCCP2Q86T23 111 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 TPCN2Q8NHX9 752 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 TATDN2Q93075 761 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 GBP5Q96PP8 586 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 TRPC6Q9Y210 931 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 TXNDC9O14530 226 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ECEL1O95672 775 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 GSCP56915 257 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 FUT2Q10981 343 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 AADACL2Q6P093 401 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 SPATA21Q7Z572 469 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 DTX3LQ8TDB6 740 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 CEP95Q96GE4 821 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 FAM129AQ9BZQ8 928 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 CFAP73A6NFT4 308 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 PSMD2Q13200 908 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 GRM4Q14833 912 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 CCDC174Q6PII3 467 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 CCHCR1Q8TD31 782 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 LRRC8CQ8TDW0 803 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 HOOK2Q96ED9 719 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ERP44Q9BS26 406 aa16.16■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 NQO1P15559 274 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 DDR1Q08345 913 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 PROM2Q8N271 834 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 BAP1Q92560 729 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 P3H4Q92791 437 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 RUNDC3BQ96NL0 473 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 IRAK4Q9NWZ3 460 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ABCC6O95255 1503 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 DLATP10515 647 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 BCRP11274 1271 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ATF2P15336 505 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 TCP10Q12799 353 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 C6orf163Q5TEZ5 329 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ERP27Q96DN0 273 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 C9orf72Q96LT7 481 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 MINPP1Q9UNW1 487 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 RASSF10A6NK89 507 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 A8MUI8 341 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 RASA4BC9J798 803 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 RASA4O43374 803 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 CA4P22748 312 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 IL9RQ01113 521 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 KCNMA1Q12791 1236 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 PPP2R5EQ16537 467 aa16.15■□□□□ 0.18
LRRN1-201ENST00000319331 KYNUQ16719 465 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms