RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.16■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 KSR1Q8IVT5 923 aa21.16■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 KRT12Q99456 494 aa21.16■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.16■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 PALMO75781 387 aa21.16■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 MYBP10242 640 aa21.16■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 EZRP15311 586 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 TNFRSF8P28908 595 aa21.16■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 HOXD13P35453 343 aa21.16■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 QPCTQ16769 361 aa21.16■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 REEP2Q9BRK0 252 aa21.16■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 NOL4O94818 638 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 LCA5LO95447 670 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 EMC10Q5UCC4 262 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 SGSM3Q96HU1 749 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 ACTN1P12814 892 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 LRRC63Q05C16 580 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 PAK2Q13177 524 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 PTPROQ16827 1216 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 STYK1Q6J9G0 422 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 SFR1Q86XK3 245 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 GDF3Q9NR23 364 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.15■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 TLR2O60603 784 aa21.14■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 USP11P51784 963 aa21.14■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.14■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 PLAAQ9Y263 795 aa21.14■□□□□ 0.98
ZNF554-201ENST00000317243 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.14■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 PPP1R2P41236 205 aa21.14■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 SEMA3FQ13275 785 aa21.14■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 DRP2Q13474 957 aa21.14■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 CRYMQ14894 314 aa21.14■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 HYIQ5T013 277 aa21.14■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 PDXDC1Q6P996 788 aa21.14■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 WDR18Q9BV38 432 aa21.14■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 GGA2Q9UJY4 613 aa21.14■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 TMOD1P28289 359 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 GIT2Q14161 759 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 NAA25Q14CX7 972 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 OR2W6PQ8NHA6 318 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 CYP3A7P24462 503 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 HGSNATQ68CP4 663 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 IQCDQ96DY2 449 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 GMCL1Q96IK5 515 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 TSG101Q99816 390 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 GMNCA6NCL1 334 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF76P36508 570 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 CD302Q8IX05 232 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 MBOAT7Q96N66 472 aa21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 CLIC2O15247 247 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 PJA2O43164 708 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 KLRC1P26715 233 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ADAM9Q13443 819 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC65Q8IXS2 484 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 VAV3Q9UKW4 847 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 SPDYE6P0CI01 402 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 SREBF1P36956 1147 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 CASP4P49662 377 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.12■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 A0A1B0GUA9 196 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 SCTRP47872 440 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 MRIQ9BWK5 157 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms