RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ZNF34Q8IZ26 560 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 C12orf60Q5U649 245 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ETNK1Q9HBU6 452 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 UBOX5O94941 541 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SP4Q02446 784 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 AADACL2Q6P093 401 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 LRIG3Q6UXM1 1119 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ATP6V1G2O95670 118 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PSMD2Q13200 908 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 MTM1Q13496 603 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 FAM186BQ8IYM0 893 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PROM2Q8N271 834 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TPCN2Q8NHX9 752 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 USTQ9Y2C2 406 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 MXRA7P84157 204 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TTBK2Q6IQ55 1244 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SLC17A8Q8NDX2 589 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SMIM24O75264 130 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ADCY8P40145 1251 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 FNTAP49354 379 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PDE6CP51160 858 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TNIP1Q15025 636 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 WDR66Q8TBY9 1149 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PNMA5Q96PV4 448 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 CCDC77Q9BR77 488 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ABCF3Q9NUQ8 709 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.54■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 F8VZ95 297 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 UFL1O94874 794 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 CASP4P49662 377 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 C18orf8Q96DM3 657 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 WDR91A4D1P6 747 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 HGSNATQ68CP4 663 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PPM1KQ8N3J5 372 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 AP1ARQ63HQ0 302 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 TPTE2Q6XPS3 522 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 FAM118BQ9BPY3 351 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 INTUQ9ULD6 942 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 PJA2O43164 708 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 KRT5P13647 590 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 FERP16591 822 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 MUM1Q2TAK8 710 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 C6orf118Q5T5N4 469 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 ZNF365Q70YC5 407 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16.52■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SLC30A10Q6XR72 485 aa16.52■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 LMNTD2Q8IXW0 634 aa16.52■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 SAAL1Q96ER3 474 aa16.52■□□□□ 0.24
USP25-201ENST00000285679 NR3C1P04150 777 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 MYBP10242 640 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 GBP1P32455 592 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 KCNJ2P63252 427 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 TMED2Q15363 201 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 AGBL2Q5U5Z8 902 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF662Q6ZS27 426 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 LRRC55Q6ZSA7 311 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 JAMLQ86YT9 394 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 BRAFP15056 766 aa16.52■□□□□ 0.23
USP25-201ENST00000285679 SEPT14Q6ZU15 432 aa16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms