RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 STMN2Q93045 179 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 RXFP1Q9HBX9 757 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC37A3O60309 1634 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 KAT6BQ8WYB5 2073 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CBX6O95503 412 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 SETSIPP0DME0 302 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 SKIP12755 728 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ATP6V1C1P21283 382 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 PPP2R5BQ15173 497 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC15Q8TF66 581 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ERP44Q9BS26 406 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 STX8Q9UNK0 236 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 HEG1Q9ULI3 1381 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 MYMKA6NI61 221 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ATP9AO75110 1047 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R2P41236 205 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CACNA2D1P54289 1103 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 AADACL2Q6P093 401 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CAPN12Q6ZSI9 719 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 MIGA2Q7L4E1 593 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 JAMLQ86YT9 394 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ACTRT1Q8TDG2 376 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 OSGEPQ9NPF4 335 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 RGPD2P0DJD1 1756 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 LCA5LO95447 670 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 NPY5RQ15761 445 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 SCYL3Q8IZE3 742 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 TPCN2Q8NHX9 752 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 SNX29Q8TEQ0 813 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 SPIRE2Q8WWL2 714 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 C18orf8Q96DM3 657 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC37BQ96QE4 947 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ASIC3Q9UHC3 531 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHA4Q9UN74 947 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 GFPT2O94808 682 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 KCNJ1P48048 391 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 RASSF2P50749 326 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 TROAPQ12815 778 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 SEC23AQ15436 765 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 TNFRSF25Q93038 417 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 MCUR1Q96AQ8 359 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 NT5C3AQ9H0P0 336 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 MYLK2Q9H1R3 596 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF3Q9NR81 526 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 WDR35Q9P2L0 1181 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CLSTN1O94985 981 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 SLC9A1P19634 815 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB16Q05516 673 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 BORCS6Q96GS4 357 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 SPAG7O75391 227 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 BAG2O95816 211 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 MYL1P05976 194 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC3Q13217 504 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 RCN1Q15293 331 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CENPPQ6IPU0 288 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF365Q70YC5 407 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 SYCE1Q8N0S2 351 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 VPS52Q8N1B4 723 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ADAM7Q9H2U9 754 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 PCMTD2Q9NV79 361 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CYP39A1Q9NYL5 469 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 STOML1Q9UBI4 398 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 JAG2Q9Y219 1238 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 OPHN1O60890 802 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ECEL1O95672 775 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 MYBP10242 640 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CFAP157Q5JU67 520 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 LRP10Q7Z4F1 713 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 EXOC3L1Q86VI1 746 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 FAM13CQ8NE31 585 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CCSER1Q9C0I3 900 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 POTEMA6NI47 508 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 GSTT1P30711 240 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 EVX2Q03828 476 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 DDX12PQ92771 950 aa12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms