RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 ZCWPW2Q504Y3 356 aa17.15■□□□□ 0.34
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CTIF-201ENST00000256413 GCC2Q8IWJ2 1684 aa17.15■□□□□ 0.34
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CTIF-201ENST00000256413 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CTIF-201ENST00000256413 FAM210AQ96ND0 272 aa17.15■□□□□ 0.34
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CTIF-201ENST00000256413 SEPT8Q92599 483 aa17.13■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 MIEF2Q96C03 454 aa17.13■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 NPHS2Q9NP85 383 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 TRIM10Q9UDY6 481 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 USP21Q9UK80 565 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 NR1I3Q14994 352 aa17.13■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 UNC13DQ70J99 1090 aa17.12■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 FOXN1O15353 648 aa17.12■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 TNNC2P02585 160 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 MORF4L2Q15014 288 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
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CTIF-201ENST00000256413 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 SEPT3Q9UH03 358 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-201ENST00000256413 PPME1Q9Y570 386 aa17.12■□□□□ 0.33
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