RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000244906.6

DKFZP434K028-201, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DKFZP434K028, Length 927 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKFZP434K028-201ENST00000244906 VTNP04004 478 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NAPAP54920 295 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PLCB3Q01970 1234 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PTPN21Q16825 1174 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ZNF484Q5JVG2 852 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CREB3L3Q68CJ9 461 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SGMS1Q86VZ5 419 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SNX27Q96L92 541 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 BRPF3Q9ULD4 1205 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 COL1A2P08123 1366 aa16.64■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SMCO2A6NFE2 343 aa16.63■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SREBF1P36956 1147 aa16.63■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PBX3P40426 434 aa16.63■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ADCY7P51828 1080 aa16.63■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FAM160B1Q5W0V3 765 aa16.63■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PDXDC2PQ6P474 469 aa16.63■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PLA2G4DQ86XP0 818 aa16.63■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RASGRP4Q8TDF6 673 aa16.63■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TCF25Q9BQ70 676 aa16.63■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LZTS1Q9Y250 596 aa16.63■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ST18O60284 1047 aa16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LAG3P18627 525 aa16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ZNF76P36508 570 aa16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ODR4Q5SWX8 454 aa16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 APOA5Q6Q788 366 aa16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NIPA1Q7RTP0 329 aa16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CRYGNQ8WXF5 182 aa16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RIPOR3Q96MK2 946 aa16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 H0Y858 1186 aa16.61■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa16.61■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa16.61■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 METTL13Q8N6R0 699 aa16.61■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TCEANC2Q96MN5 208 aa16.61■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.61■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.61■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CFAP54Q96N23 3096 aa16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 GFRA3O60609 400 aa16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CDC27P30260 824 aa16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CLCN3P51790 818 aa16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CKAP2LQ8IYA6 745 aa16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LINC01465Q8N7H1 131 aa16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KREMEN2Q8NCW0 462 aa16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ADAMTS10Q9H324 1103 aa16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 BARHL2Q9NY43 387 aa16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FSD2A1L4K1 749 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CYP3A4P08684 503 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 AP3B2Q13367 1082 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RTN1Q16799 776 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 EFCAB12Q6NXP0 572 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KANK3Q6NY19 840 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TMC7Q7Z402 723 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FEZF2Q8TBJ5 459 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ZNF558Q96NG5 402 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 POMKQ9H5K3 350 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa16.59■□□□□ 0.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MYO15AQ9UKN7 3530 aa16.58■□□□□ 0.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.58■□□□□ 0.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 C2CD4DB7Z1M9 353 aa16.58■□□□□ 0.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 BRD1O95696 1058 aa16.58■□□□□ 0.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 WEE2P0C1S8 567 aa16.58■□□□□ 0.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SRGAP2BP0DMP2 458 aa16.58■□□□□ 0.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms